Dans la dernière phase de la guerre, la gare de Kochendorf est devenue un point de transbordement pour les prisonniers des camps de concentration ainsi que pour les machines et les matériaux de construction pour l'industrie de l'armement. Les premières machines Heinkel-Hirth sont arrivées en août 1944. Ils ont été chargés sur un chemin de fer léger et transportés jusqu'au puits de l'autre côté des voies. La mine a été convertie en usine d'armement souterraine. Jusqu‘en mars 1945, de plus en plus de sociétés d'armement avaient introduit des machines dans la mine. La station devait également être utilisée pour le retrait des armements finis tels que les turbines pour des avions de combat, les moteurs pour des sous-marins, les transmissions pour des chars et des mitrailleuses. Pour cette raison, un autre chemin de fer léger a conduit à deux nouvelles entrées de la mine en construction.
Le 3 septembre 1944, les premiers prisonniers du camp de concentration descendaient d'un train à la gare. Le convoi avec 653 prisonniers est venu de Thil et Audun-le-Tiche en Lorraine. Les SS avaient évacué les sous-camps du camp de concentration de Natzweiler devant l'avancée de l'armée américaine. Lorsque le convoi arriva à Coblence, le bureau du commandant à Natzweiler décida d'envoyer des gardes et des prisonniers à Kochendorf, où un nouveau camp de concentration etait en train d'être construit. La plupart des prisonniers étaient des Juifs hongrois qui avaient été déportés à Auschwitz et qui ont été selectionés pour le travail forcé d´armenent au printemps 1944. Leurs familles ont été gazées et des hommes et des femmes valides ont été sélectionnés pour le travail forcé. Le transport a également amené le premier homme mort. Les SS utilisaient les prisonniers comme esclaves dans l'usine souterraine de missiles.
Le 1er octobre 1944, un deuxième convoi suivit : un train en provenance de Sachsenhausen amena 700 prisonniers de nombreuses nations au camp de concentration de Kochendorf. Les groupes les plus importants étaient les Soviétiques, dont beaucoup étaient prisonniers de guerre, et les déportés de France, dont certains étaient des résistants.
Trois semaines plus tard, le 23 octobre, la Waffen-SS chargea 92 prisonniers de Kochendorf malades et épuisés dans un train qui les emmena au sous-camp d'Allach du camp de concentration de Dachau. Presque tous les prisonniers étaient des Juifs hongrois qui n'étaient plus en mesure de travailler après un peu moins de deux mois dans le camp de concentration de Kochendorf. Le prochain convoi avec des prisonniers est probablement arrivé le 3 janvier 1945 provenant du camp de concentration de Flossenbürg. Le train était parti pour Dachau, mais pour une raison inconnue, il avait été dévié vers Kochendorf.
Le 24 janvier, les prisonniers sont ramenés à Flossenbürg. Au moins 3 des 101 prisonniers de différentes nations n'avaient pas survécu au transport et au séjour au camp.
En février 1945, un train de transport a amené 50 prisonniers qui n'étaient plus en mesure de travailler au soi-disant camp de la mort de Vaihingen situé près de Ludwigsburg dans l‘état de Bade-Wurtemberg. Les deux derniers convois de prisonniers atteignirent Kochendorf le 10 mars. Tout d'abord, un convoi avec 200 prisonniers est arrivé d'Unterriexingen, où se trouvait un sous-camp du camp de concentration de Vaihingen. Presque tous les déportés étaient des Juifs polonais. Les SS recevaient les prisonniers avec des chiens de garde. Probablement le même jour, des prisonniers du camp de concentration de Mannheim-Sandhofen sont arrivés. La plupart d'entre eux étaient des Polonais de Varsovie.
L'évacuation du camp de concentration de Kochendorf était déjà apparente à cette époque. Le 29 mars 1945, le moment était venu. 398 prisonniers, pour la plupart de l'infirmerie du camp de concentration, ont été amenés à la gare par des agriculteurs en calèches. Cependant, le transport a été retardé de quelques heures car la nourriture manquait. Le chef de gare a finalement décidé que le train devait partir sans nourriture. Au moins 54 prisonniers sont morts sur le chemin de Dachau – de faim, de froid, de faiblesse et des coups des gardes.